Au printemps 1793, Alex est un des points forts de l’insurrection dans la vallée de Thônes contre le pouvoir de la bourgeoisie jacobine. Au mois d'août 1793, quand Annecy se révolte à son tour contre les Jacobins, le comte d'Alex, qui fut premier syndic de la ville, prend la tête de l'émeute, poussé par la population. Pris dans une embuscade, il est assassiné aux Marquisats. Le château est alors confisqué et vendu comme bien national.